Secuenciamos regiones genómicas seleccionadas del genoma de E. coli 83972 de una segunda inoculación. Específicamente, examinamos los loci cromosómicos, que fueron alterados en los aislamientos de E. coli 83972 del primer evento de inoculación en PI-2, PII-4 y PIII-4. Varios loci fueron alterados repetidamente en re-aislados de la cepa 83972 del mismo huésped ( Tabla S2 ). Esto incluyó la región promotora fecIR donde el nuevo aislamiento de la segunda colonización vesical del paciente PII llevó una mutación puntual 23 nucleótidos aguas arriba del SNP detectado previamente en la cepa PII-4. Los nuevos aislamientos de la primera y segunda inoculación en pacientes PI y PIII tuvieron mutaciones puntuales diferentes en el gen frmR . El gen mdoH fue mutado en aislamientos PI-2 y PII-4 desde la primera inoculación y se detectaron mutaciones en re-aislamientos desde la segunda inoculación en los tres pacientes. Por el contrario, estas alteraciones genómicas no ocurrieron en cinco aislados de dos in vitro independientes.cultivos de orina de E. coli 83972, lo que sugiere que el entorno del huésped puede impulsar la selección de estos cambios genómicos.
REFERENCIA BILBIOGRAFICA:
Zdziarsk J, Brzuszkiewicz E, Wullt B. Host Imprints on Bacterial Genomes—Rapid, Divergent Evolution in Individual Patients. PudMed [Internet]. 2010 [cited 14 June 2020];. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2928814/#ppat.1001078.s011
REf antigua del 2010 0.5
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